Ana sayfa Bilim/Çevre Gezici dalga iyon hareket kabiliyeti kütle spektrometrisi, altın parmakların yapılarını aydınlatıyor

Gezici dalga iyon hareket kabiliyeti kütle spektrometrisi, altın parmakların yapılarını aydınlatıyor

120
0
PAYLAŞ

Altın içeren ilaçlar, romatoid artrit gibi durumların tedavisinde yüzyıllarca kullanılmıştır. Buna ek olarak, kansere ve HIV’e karşı etkili olabilirler. Altın iyonları, çinko iyonlarını çinko parmaklardan ilmikli, nükleik asit bağlayıcı protein alanlarından dışarı çıkarmak için çalıştıkları bir mekanizma ortaya çıkabilirdi. Amerikalı araştırmacılar, bu gibi “altın parmakları” iyon hareket kabiliyeti kütle spektrometresi kullanarak karakterize ettiler. Tam altın bağlama yerlerini tespit ettiler.

Altın içeren ilaçlar, romatoid artrit gibi durumların tedavisinde yüzyıllarca kullanılmıştır. Buna ek olarak, kansere ve HIV’e karşı etkili olabilirler. Altın iyonları, çinko iyonlarını çinko parmaklardan – ilmikli, nükleik asit bağlayıcı protein alanlarından dışarı çıkarmak için – çalıştıkları bir mekanizma ortaya çıkabilirdi. Amerikalı araştırmacılar, bu gibi “altın parmakları” iyon hareket kabiliyeti kütle spektrometresi kullanarak karakterize ettiler. Dergide belirtildiği gibi Angwandte Chemie kişilere, site bağlayıcı kesin altın belirledi.

Virginia Commonwealth Üniversitesi’nden (Richmond, ABD) Nicholas P. Farrell, “Çinko parmaklarındaki çinko iyonları, proteinin sisteini ve histidin kalıntılarının dört kükürt veya azot atomuna bağlanır” diyor. Altın iyonları sadece iki amino asit parçasına bağlanıyor ve proteinin konformasyonunu değiştiriyor “altın parmakları” nükleik asitlerle artık bağlanamıyor ve bu da terapötik açıdan yararlı olabilir. ”

Metal iyonları için çeşitli potansiyel bağlanma alanları olmasına rağmen, her metalloprotein genellikle tek bir konformasyonu tercih eder. Spesifik bağlanma alanlarının bir konformer karışımı içinde nerede olduğunu önceden belirlemek mümkün değildi. Farrell ve ekibi şimdi iki altın parmakları yakından inceledi. Farrell’e göre, “Sp1 transkripsiyon faktörünün çinko parmak 3’ünde çinkenin yerini alması yalnızca bir altın parmak türüne yol açıyor.” Araştırmacılar bunu doğrusal bir Cys-Au-His bağına sahip olarak tanımladılar. Virüsün çoğaltılmasında kritik bir rol oynayan HIV nucleocapsid proteini durumunda “proteinin çinko parmağına (NCp7-F2) altın koymak”, lineer Cys-Au ile üç farklı altın parmak türüne yol açar -Cys motifleri, bunlardan biri açıkça baskın. ”

Araştırmacıların başarısı, gezici dalga iyon hareket kabiliyeti kütle spektrometresi (TWIM-MS) olarak adlandırılan özel bir analitik yöntem kullanmalarından kaynaklanmaktadır. Bu teknikte, analiz edilecek moleküller iyonize edilir ve iyonlar bir gaz içinde bir elektrik alanı tarafından hızlandırılır. Gaz molekülleri ile çarpışmalar, iyonların yavaşlamasına neden olur. Büyük, hacimli moleküller daha sıklıkla çarpıştığından küçük, kompakt moleküllerden daha yavaştır. Bu aynı zamanda izomerleri ayırt etmeyi ve ayırmayı mümkün kılıyor, çünkü aynı kütleye sahip olsalar da, farklı geometrileri farklı hareketlilik ile sonuçlanıyor. Hareketliliklerine göre ayrıldıktan sonra, tek tek iyonlar çarpışma ile indüklenen ayrışma (CID) ile parçalanabilir ve fragmanlar tekrar kütle spektrometresi ile ölçülebilir.

Farrell, “Bu şekilde, altın modifiye edilmiş çinko parmakları NCp7-F2 ve Sp1-F3 için spesifik bağlanma yerlerini ve modlarını tanımladık” diyor Farrell. “İyon hareket kabiliyeti kütle spektrometrisi, böylece, çinko parmak proteinlerinde çinkonun değişimi ile bu tür reaksiyonların seçiciliği ve reaktivitesi geometride meydana gelen değişiklikler hakkında önemli bilgiler sağlar.Bu, yeni metal bazlı araştırmalara fayda sağlayabilir Antiviral ve antitümör ilaçlar. ”

Kaynak:

Wiley

BİR CEVAP BIRAK

Please enter your comment!
Please enter your name here