Tedavi zorluğu çeken kanserler hastalar için, doktorlar DNA’daki mevcut tüm terapilerin hedef alabileceğini gösteren hataları tanımlamak için giderek genomik tümör testlerine güveniyorlar. Ancak bu yaklaşım, kanser hücrelerini sürükleyen kötü huylu proteinleri ve mevcut tedavileri hedef alabileceklerini gözler önüne seriyor.
Tedavi zorluğu çeken kanserler hastalar için, doktorlar DNA’daki mevcut tüm terapilerin hedef alabileceğini gösteren hataları tanımlamak için giderek genomik tümör testlerine güveniyorlar. Ancak bu yaklaşım kanser hücrelerini sürükleyip başka tedavilerle hedeflenmiş olabilecek başka bir potansiyel belirteç – haydut proteinleri – görmektedir.
DNA, vücudun genetik planı olarak tanımlanabiliyorsa, proteinler planı yürüten inşaat işçileri olarak düşünülebilir. Planı incelemek kanser dahil olmak üzere genetik hastalıkları anlamada hayati önem taşıyabilir, ancak bu odak da işçilerle ortaya çıkan bazı sorunların kaçındığı anlamına gelmektedir.
Hastalardan nakledilen göğüs tümörlü farelerin incelenmesi, St. Louis’deki Washington Üniversitesi Tıp Fakültesi araştırmacıları, MIT ve Harvard’ın Geniş Enstitüsü ve Baylor Tıp Fakültesi, bu tümörlerdeki proteinleri analiz etti. Araştırmacılar, bazı kanserlere karşı etkili olabilecek bazı ilaçların belirlenmesinde bazı protein değişikliklerinin yapılabileceğini gösterdiler. Çalışma, Ulusal Kanser Enstitüsü (NCI) Klinik Proteomik Tümör Analizi Konsorsiyumu çalışmalarının bir parçasıdır.
Çalışma 28 Mart Nature Communications’da yayınlandı .
Washington Üniversitesi’nden tıpta doçent olan Li Ding, PhD, “Proteinler hücre içindeki biyolojik fonksiyonların çoğunu gerçekleştiriyor” dedi. “DNA dizisinin bilinmesi, hücrelerde işleyen proteinler hakkında her şeyi bize otomatik olarak anlatmaz, bu yeni terapileri tanımlamak için keşfetmesi gereken tümör karmaşıklığının bir başka tabakasıdır.”
Ding, kütle spektrometresi adı verilen bir teknolojideki son gelişmelerin ve büyük miktarda verilerin analiz edilmesine yönelik tekniklerin tümör hücrelerindeki proteinlerin karmaşık çalışmalarını mümkün kıldığını söyledi. Tümörlerde proteinlerin sistematik olarak çalışılmasına öncelik vermenin bir diğer nedeni, kanser proteomiği, genetik araştırmalardan geliştirilen kanser terapilerinin büyük çoğunluğunun aslında proteinleri hedeflemesi.
Washington Üniversitesi’ndeki Proteomics Shared Resource tıp profesörü ve rektör yardımcısı R. Reid Townsend, MD “Kanserin haydut proteinlerini belirlemek yeni ilaç geliştirme yönünde önemli bir yol” dedi.
Washington Üniversitesi Tıp Fakültesi, The McDonnell Genom Enstitüsü Müdür Yardımcısı Ding, “Genomik bulgularımızı teyit etmek ve doğrulamak için proteomik kullanabiliriz” dedi. “Buna ek olarak, kanseri yönlendiren ve” kötü niyetli “protein miktarı, spesifik formu ya da bildiğimiz proteinlerin kimyasal modifikasyonlarının türü ve kapsamı da dahil olmak üzere bireysel hasta tümörlerine özgü ek olayları ortaya çıkaran başka bir araçtır Onaylı veya araştırmacı ilaçlar ile tedavi edilebilirler.Bu terapileri farelerde de hastalarımızda değerlendirmeden önce test edebiliriz “dedi.
Geniş Enstitüsün Steven A. Carr, ekibin, sağlıklı ve hastalıklı hücrelerin iletişim biçiminde merkezi bir rol oynayan fosforilasyon adlı bir kimyasal modifikasyon analiz ettiğini söyledi.
Carr, “Böyle bir sinyallemede bozulma ya da iyileşme genellikle doğrudan hastalık mekanizması ile ilgilidir ve terapi için hedef alınabilir” dedi.
Araştırmacılar, örneklerin farelere nakledildikten sonra göğüs kanseri hastalarının 24 tümör numunesini inceledi. Nakledilen 22 numunenin genetik ve proteomik kimlikleri belirli meme kanseri tipleri olarak kalmıştır. Tümörlerin proteomik analizi ayrıca ilaçlara cevap verme potansiyeli olan çoklu protein hedefleri tanımladı.
Örneğin, araştırmacılar, PI3K inhibitörleri ve mTOR inhibitörleri olarak adlandırılan araştırma ilaçları ile ayrı ayrı ve kombinasyon halinde tümöre bağımlı olarak hedef alınabilen çoklu protein yolaklarının dialed-up etkinliğini gösterdiler. Ayrıca, ikili ERBB2 / EGFR inhibitörü lapatinib gibi HER2 pozitif meme kanseri adı verilen meme tümörüne karşı uyuşturucuların, tümör proteinlerinin analizi dikkate alındığında, halihazırda aldıkları dozdan daha fazla hastaya fayda sağlayabileceğini gösterdiler.
Bu tümör modellerinin çoğunun belirli meme kanseri tipleri tekrar edildiği halde bilim adamları, 24 tümörden ikisinin farelere transplantasyondan sonra tamamen farklı bir kanser tipine dönüştüğünü görmekten şaşırdıklarını söyledi. Araştırmacılar, göğüs kanseri yerine lenfoma benzeri kansere neden olan virüs Epstein-Barr tarafından yönlendirildiklerini söyledi. Lenfomalar, farelere nakledilen göğüs tümörlerinde bulunan lenfatik dokudan kaynaklanabilen immün hücrelerin kanserleridir.
Lenfoma benzeri kanserlerin analizi, bu tip tümörün ilk proteomik çalışmasıydı. Kasıtsız olsa da Ding, analizin neden BTK adlı bir proteini inhibe eden araştırmacı ilaçların lenfoma hastalarının tedavisinde etkili olduğunu açıklayan bir açıklama yaptığını söyledi.
Ding, “İlaçlarla direkt olarak etkileşime giren protein olduğundan, hasta kökenli tümör modellerinde proteomik üzerine çalışmanın gücü, farelerde ilaç tedavisini test etme kabiliyetidir” dedi. “Kanser proteomik alanında ölçüm hızını artıran ilerlemelerle, hasta tümörlerinin genomik ve proteomik analizlerini içeren bir geleceğe doğru ilerliyoruz.”
Baylor’un ortak yazarı Matthew J. Ellis, MD, doktor, kabul etti. “Fare çalışması, bu teknolojileri hasta materyallerinin gerçek zamanlı analizi için uyarlayacak kadar umut vericidir, böylece klinik denemeler bu yeni tanı ve ilaç seçim yaklaşımını test etmek için tasarlanabilir” dedi.
Kaynak:
Washington Üniversitesi Tıp Fakültesi
